İçerik

• Yazılıma Genel Bakış
• Desteklenen Dosya Türleri
• Birincil dosya uzantısı
• Integrated Genome Browser 9 tarafından kullanılan diğer dosya uzantıları

versiyon (6/29/2016 itibariyle)	9
Platformlar
Lisans	Açık kaynak
Kategori	İlmi

Daha Fazla Bilgi (yayıncının web sitesini ziyaret edin)

Değerlendirme: 2.8 / 5 (6 Oy)

Yazılıma Genel Bakış

Ana Özellikler

• GenBank ve FASTA gibi çeşitli genom formatlarını destekler
• Yakınlaştırma ve kaydırma animasyonlarıyla verilerle etkileşime geçin
• QuickLoad sitelerinden genomlara erişin ve yükleyin
• Verileri çeşitli grafik formlarına dönüştürün
• Dropbox aracılığıyla ortak çalışanlarla veri paylaşın
• Ek işlevsellik için eklentileri yükleyin

Entegre Genom Tarayıcı (IGB), büyük genomik veri setlerini görüntülemek ve keşfetmek için kullanılan açık kaynaklı bir programdır. Çeşitli veri biçimlerini görüntüleyebilir, verilerinizle etkileşime girebilir, grafikler oluşturabilir, bilgilerinizi görüntü olarak kaydedebilir ve verilerinizi ortak çalışanlarla paylaşabilirsiniz.

IGB, ek açıklamalardan ve hizalı dizilerden verileri görüntülemenizi sağlar. Program, FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband ve GenBank gibi çeşitli formatları destekler. Veri alabilir ve veri farklarını vurgulamak için uyuşmayan grafikler ve kapsamı göstermek için derinlik grafikler dahil çeşitli grafik formlarına dönüştürebilirsiniz. IGB’nin yakınlaştırma ve kaydırma animasyonlarını kullanarak verilerinizle de etkileşime girebilirsiniz.

IGB, görselleştirme amacıyla basit dizinler, diziler ve diğer veri dosyalarından oluşan QuickLoad sitelerinden genomlara erişmenizi ve yüklemenizi sağlar. IGB, komut dosyaları kullanarak işlevsellik ve iş akışı otomasyonu eklemek için eklenti desteğiyle gelişmiş işlevsellik sunar. IGB ayrıca, verilerinizi paylaşmanız için yüksek kaliteli bir JPEG, PNG veya SVG resmi olarak yayınlaması ya da ortak çalışanlarınıza projenize erişim sağlamak için Dropbox'ta veri depolaması gibi gelişmiş özellikler sunar.

IGB öncelikle üniversite araştırmacıları, biyologlar ve biyoinformatikçiler tarafından kullanılmaktadır. Çeşitli genom veri formatlarını açmak, verileri farklı grafikler olarak görselleştirmek ve ortak çalışanlarla veri paylaşmak için gelişmiş araçlar sunar. Maalesef, program sürekli gelişim için verilen hibelere dayanmaktadır, bu da başvuru için desteğin herhangi bir zamanda sona erebileceği anlamına gelir. Bununla birlikte, Integrated Genome Browser, genom verilerini araştırmak ve analiz etmek isteyen kullanıcılar için hala yetenekli, özelleştirilebilir bir programdır.

Desteklenen Dosya Türleri

Birincil dosya uzantısı

.XML - XML ​​Dosyası

Integrated Genome Browser 9 tarafından kullanılan diğer dosya uzantıları

Desteklenen Dosya Türleri
.YATAK	UCSC BED Annotation Track Dosyası
.DAS	DeltaMaster Analiz Oturumu
.FA	FASTA Biçimli Sıra Dosyası
.FAS	FASTA Sıra Dosyası
.FASTA	FASTA Sıra Dosyası
.GB	GenBank Veri Dosyası
.SGR	SGR Genom Veri Dosyası
.USEQ	USeq Genom Veri Dosyası